Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA2P17301 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms