Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOT1P17174 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOT1P17174 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOT1P17174 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOT1P17174 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOT1P17174 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOT1P17174 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOT1P17174 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms