Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms