Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPCAMP16422 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms