Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLS3P13797 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLS3P13797 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLS3P13797 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLS3P13797 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLS3P13797 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLS3P13797 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLS3P13797 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLS3P13797 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLS3P13797 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLS3P13797 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLS3P13797 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLS3P13797 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms