Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms