Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT5P13647 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT5P13647 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT5P13647 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT5P13647 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT5P13647 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT5P13647 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT5P13647 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT5P13647 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT5P13647 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT5P13647 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms