Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFTRP13569 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFTRP13569 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFTRP13569 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFTRP13569 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFTRP13569 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFTRP13569 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFTRP13569 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFTRP13569 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFTRP13569 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFTRP13569 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFTRP13569 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFTRP13569 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFTRP13569 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFTRP13569 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFTRP13569 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFTRP13569 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFTRP13569 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFTRP13569 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFTRP13569 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFTRP13569 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFTRP13569 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFTRP13569 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFTRP13569 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFTRP13569 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFTRP13569 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFTRP13569 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFTRP13569 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CFTRP13569 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CFTRP13569 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFTRP13569 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFTRP13569 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFTRP13569 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFTRP13569 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFTRP13569 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFTRP13569 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFTRP13569 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFTRP13569 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CFTRP13569 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CFTRP13569 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CFTRP13569 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFTRP13569 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFTRP13569 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFTRP13569 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CFTRP13569 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFTRP13569 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CFTRP13569 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CFTRP13569 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CFTRP13569 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CFTRP13569 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CFTRP13569 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms