Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH1P12830 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDH1P12830 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH1P12830 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH1P12830 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH1P12830 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH1P12830 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH1P12830 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH1P12830 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH1P12830 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH1P12830 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH1P12830 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH1P12830 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH1P12830 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH1P12830 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH1P12830 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH1P12830 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH1P12830 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms