Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT3P12035 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT3P12035 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT3P12035 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT3P12035 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT3P12035 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT3P12035 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT3P12035 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT3P12035 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT3P12035 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms