Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOP2AP11388 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2AP11388 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms