Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYGBP11216 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYGBP11216 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYGBP11216 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYGBP11216 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGBP11216 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGBP11216 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGBP11216 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGBP11216 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PYGBP11216 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGBP11216 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGBP11216 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGBP11216 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGBP11216 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGBP11216 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGBP11216 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGBP11216 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYGBP11216 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYGBP11216 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYGBP11216 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYGBP11216 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYGBP11216 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYGBP11216 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYGBP11216 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms