Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms