Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL3P10147 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCL3P10147 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3P10147 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3P10147 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3P10147 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3P10147 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms