Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI2P10070 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI2P10070 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI2P10070 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI2P10070 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI2P10070 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI2P10070 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI2P10070 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI2P10070 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI2P10070 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI2P10070 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI2P10070 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI2P10070 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI2P10070 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI2P10070 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI2P10070 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI2P10070 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI2P10070 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI2P10070 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GLI2P10070 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GLI2P10070 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GLI2P10070 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GLI2P10070 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GLI2P10070 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GLI2P10070 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
GLI2P10070 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GLI2P10070 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GLI2P10070 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI2P10070 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
GLI2P10070 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
GLI2P10070 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI2P10070 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI2P10070 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI2P10070 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI2P10070 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI2P10070 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI2P10070 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI2P10070 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI2P10070 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI2P10070 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI2P10070 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI2P10070 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI2P10070 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI2P10070 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI2P10070 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI2P10070 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI2P10070 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI2P10070 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI2P10070 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI2P10070 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI2P10070 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI2P10070 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI2P10070 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI2P10070 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI2P10070 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI2P10070 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI2P10070 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI2P10070 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI2P10070 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI2P10070 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI2P10070 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI2P10070 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GLI2P10070 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GLI2P10070 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GLI2P10070 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GLI2P10070 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GLI2P10070 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms