Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms