Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG3L1P0CL83 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STAG3L1P0CL83 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STAG3L1P0CL83 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms