Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms