Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRR29P0C7W0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms