Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTAP09496 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTAP09496 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTAP09496 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTAP09496 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTAP09496 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTAP09496 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTAP09496 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTAP09496 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTAP09496 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTAP09496 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTAP09496 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTAP09496 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms