Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYP3A4P08684 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms