Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI1P08151 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI1P08151 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI1P08151 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI1P08151 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI1P08151 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI1P08151 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI1P08151 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI1P08151 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI1P08151 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI1P08151 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI1P08151 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI1P08151 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI1P08151 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI1P08151 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms