Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSLP07711 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSLP07711 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSLP07711 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSLP07711 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSLP07711 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSLP07711 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSLP07711 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSLP07711 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms