Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLBP06746 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLBP06746 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLBP06746 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLBP06746 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLBP06746 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLBP06746 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLBP06746 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLBP06746 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLBP06746 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLBP06746 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLBP06746 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLBP06746 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLBP06746 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLBP06746 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms