Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPN1P04843 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN1P04843 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN1P04843 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN1P04843 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN1P04843 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN1P04843 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms