Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRM2P04554 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRM2P04554 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRM2P04554 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRM2P04554 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms