Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-AP01891 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-AP01891 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms