Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MATN4O95460 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MATN4O95460 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MATN4O95460 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MATN4O95460 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MATN4O95460 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MATN4O95460 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MATN4O95460 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MATN4O95460 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MATN4O95460 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MATN4O95460 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MATN4O95460 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MATN4O95460 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MATN4O95460 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MATN4O95460 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MATN4O95460 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms