Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms