Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRATO95237 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRATO95237 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRATO95237 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRATO95237 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRATO95237 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRATO95237 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRATO95237 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRATO95237 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRATO95237 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRATO95237 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRATO95237 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRATO95237 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRATO95237 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRATO95237 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRATO95237 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRATO95237 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRATO95237 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRATO95237 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRATO95237 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRATO95237 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRATO95237 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRATO95237 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRATO95237 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRATO95237 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRATO95237 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRATO95237 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRATO95237 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRATO95237 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRATO95237 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRATO95237 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRATO95237 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRATO95237 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRATO95237 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms