Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms