Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT38O76015 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT38O76015 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT38O76015 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT38O76015 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT38O76015 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT38O76015 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT38O76015 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT38O76015 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT38O76015 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT38O76015 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT38O76015 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT38O76015 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT38O76015 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT38O76015 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT38O76015 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT38O76015 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT38O76015 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT38O76015 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT38O76015 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT38O76015 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT38O76015 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT38O76015 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT38O76015 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT38O76015 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT38O76015 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT38O76015 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT38O76015 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT38O76015 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT38O76015 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT38O76015 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT38O76015 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT38O76015 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT38O76015 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms