Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CAPN15O75808 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms