Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP3O75386 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP3O75386 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP3O75386 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP3O75386 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP3O75386 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP3O75386 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TULP3O75386 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TULP3O75386 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms