Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45BO75293 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms