Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PPFIA3O75145 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA3O75145 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms