Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSVO60911 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSVO60911 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSVO60911 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTSVO60911 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTSVO60911 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSVO60911 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSVO60911 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSVO60911 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSVO60911 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSVO60911 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSVO60911 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSVO60911 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSVO60911 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSVO60911 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSVO60911 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTSVO60911 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTSVO60911 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTSVO60911 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTSVO60911 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CTSVO60911 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSVO60911 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms