Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOBOXO60393 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms