Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms