Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HTATSF1O43719 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms