Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KCNQ3O43525 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
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