Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OIP5O43482 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OIP5O43482 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OIP5O43482 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OIP5O43482 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OIP5O43482 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OIP5O43482 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OIP5O43482 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OIP5O43482 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OIP5O43482 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OIP5O43482 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OIP5O43482 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OIP5O43482 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OIP5O43482 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OIP5O43482 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OIP5O43482 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OIP5O43482 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OIP5O43482 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms