Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF3O43395 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms