Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SART1O43290 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SART1O43290 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SART1O43290 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SART1O43290 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SART1O43290 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SART1O43290 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SART1O43290 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SART1O43290 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SART1O43290 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SART1O43290 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SART1O43290 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SART1O43290 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SART1O43290 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SART1O43290 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SART1O43290 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SART1O43290 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SART1O43290 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SART1O43290 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SART1O43290 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SART1O43290 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SART1O43290 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SART1O43290 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SART1O43290 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SART1O43290 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SART1O43290 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SART1O43290 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms