Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLXNB1O43157 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms