Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAPBPO15533 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAPBPO15533 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAPBPO15533 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAPBPO15533 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAPBPO15533 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAPBPO15533 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAPBPO15533 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAPBPO15533 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAPBPO15533 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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