Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms