Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCAO15360 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCAO15360 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCAO15360 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCAO15360 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCAO15360 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCAO15360 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCAO15360 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCAO15360 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCAO15360 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCAO15360 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCAO15360 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCAO15360 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FANCAO15360 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FANCAO15360 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FANCAO15360 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FANCAO15360 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCAO15360 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
FANCAO15360 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
FANCAO15360 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FANCAO15360 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
FANCAO15360 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
FANCAO15360 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FANCAO15360 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
FANCAO15360 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FANCAO15360 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.81■■■■□ 3
FANCAO15360 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
FANCAO15360 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FANCAO15360 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FANCAO15360 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FANCAO15360 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FANCAO15360 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms