Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms