Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNDC9O14530 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms